Appleから「パフォーマンスアップデート 1.0 (Snow Leopard)」が出ていました。ソフトウェア・アップデートから可能なようです。Leopard（10.5）版「パフォーマンスアップデート 1.0 (Leopard)」もあります。

一般情報 パフォーマンスアップデート 1.0 (Snow Leopard)

このアップデータにより、ごく一部のカスタマーにより報告されているハード・ドライブに起因する間欠的な動作速度の低下が解決されます。